Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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