Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rab28Q99KL7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rab28Q99KL7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rab28Q99KL7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rab28Q99KL7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rab28Q99KL7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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