Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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