Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms