Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Lrif1Q8CDD9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Lrif1Q8CDD9 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Lrif1Q8CDD9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lrif1Q8CDD9 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Lrif1Q8CDD9 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Lrif1Q8CDD9 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Lrif1Q8CDD9 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Lrif1Q8CDD9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Lrif1Q8CDD9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Lrif1Q8CDD9 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrif1Q8CDD9 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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