Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Nhlrc3Q8CCH2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
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Nhlrc3Q8CCH2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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