Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp47Q8BY87 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms