Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ssc5dQ8BV57 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssc5dQ8BV57 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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