Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms