Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Lrfn4Q80XU8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Lrfn4Q80XU8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lrfn4Q80XU8 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrfn4Q80XU8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrfn4Q80XU8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrfn4Q80XU8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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