Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ttc28Q80XJ3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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