Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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