Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms