Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Nrp2-201ENSMUST00000027112 4216 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Dgkd-201ENSMUST00000027517 5695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms