Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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