Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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