Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms