Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Rpusd4-201ENSMUST00000034543 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm14407-201ENSMUST00000121260 447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 AC158122.1-201ENSMUST00000227398 673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm8055-201ENSMUST00000099956 1008 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Rpsa-ps11-201ENSMUST00000118446 889 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Glns-ps1-201ENSMUST00000120291 1118 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 AC120406.1-201ENSMUST00000220362 482 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrriq1Q0P5X1 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms