Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MestQ07646 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MestQ07646 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms