Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms