Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms