Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms