Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms