Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psme1P97371 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psme1P97371 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms