Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms