Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfixP70257 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfixP70257 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfixP70257 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfixP70257 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfixP70257 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfixP70257 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NfixP70257 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfixP70257 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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NfixP70257 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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NfixP70257 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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NfixP70257 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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NfixP70257 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfixP70257 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfixP70257 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfixP70257 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfixP70257 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfixP70257 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfixP70257 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfixP70257 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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NfixP70257 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfixP70257 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfixP70257 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NfixP70257 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NfixP70257 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms