Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms