Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2kP61087 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms