Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms