Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nedd1P33215 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms