Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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