Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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