Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkchP23298 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms