Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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