Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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HbaP01942 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HbaP01942 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HbaP01942 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HbaP01942 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HbaP01942 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HbaP01942 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms