Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms