Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20696H3BJN7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20696H3BJN7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms