Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms