Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rrn3B2RS91 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms