Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Atp8b5A3FIN4 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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Atp8b5A3FIN4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms