Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ush1cQ9ES64 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Ush1cQ9ES64 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ush1cQ9ES64 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ush1cQ9ES64 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ush1cQ9ES64 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ush1cQ9ES64 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ush1cQ9ES64 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ush1cQ9ES64 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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