Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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