Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ptp4a3Q9D658 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ptp4a3Q9D658 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ptp4a3Q9D658 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ptp4a3Q9D658 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ptp4a3Q9D658 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ptp4a3Q9D658 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms