Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms