Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms