Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N7

Chaf1b, Chromatin assembly factor 1 subunit B, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1bQ9D0N7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chaf1bQ9D0N7 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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