Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms