Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PsenenQ9CQR7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PsenenQ9CQR7 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms