Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

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Length 1,463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rims1Q99NE5 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rims1Q99NE5 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rims1Q99NE5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims1Q99NE5 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms