Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms